滯留發票一般是銷貨方對購貨方開具增值稅專用發票，而購貨方由于種種原因在180日內（2010年1月1日起由90日改為180日）未將專用發票認證及抵扣的增值稅專用發票。目前，由于金稅工程全國聯網，所以，增值稅發票只要一經防偽稅控系統開出，而購貨方未去認證則該發票就沒有對應的抵扣信息，就會造成滯留。究竟哪些原因導致了滯留發票的產生呢？對此，稅務網校稅票處理欄目進行了總結和梳理。滯留發票產生的原因主要有以下幾個方面：

　　1.屬于購進免稅貨物用，專用發票不得認證；

　　2.屬于購進非應稅項目用，專用發票不得認證；

　　3.銷貨方未將專用發票交給購貨方，造成存根聯滯留；

　　4.購貨方接到專用發票超過180日認證期而無法認證抵扣，造成存根聯滯留；

　　5.購貨方在小規模納稅人期間取得對方開具的專用發票不能抵扣；

　　6.購貨方發生走逃或注銷。

　　一般情況下，增值稅專用票的稅務管理很嚴格，稅局一旦發現問題會予以追究。實際中，各地稅局會要求存在滯留發票的公司必須對滯留的原因加以說明，同時也會對存在疑點的公司進行現場檢查。有些公司存在滯留發票，目的是想偷漏稅，隱瞞銷售收入同時隱瞞抵扣發票，使稅負從表面上看與正常公司相符，這就造成很多該抵扣的發票不去稅局抵扣，造成發票滯留。

　　以上，我們了解了滯留發票產生的原因，那么，企業應如何正確處理滯留發票呢？

　　1、企業若取得不能抵扣的專用發票，一個途經是要銷貨方重新開具普通發票，另一個途經是把發票拿去認證抵扣，但同時做全額進項轉出。

　　2、購貨方購進屬于免稅貨物用、非應稅項目用，要求銷貨方開具普通發票。

　　3、購貨方屬于小規模納稅人期間，要求銷貨方開具普通發票。

　　4、購貨方接到專用發票超過180日認證期而無法認證抵扣，購貨方要自我檢討一下管理流程，應在180日內盡快認證。