國家出于保護農(nóng)業(yè)生產(chǎn)者的利益，出臺憑收購發(fā)票抵扣的政策，實際上農(nóng)業(yè)生產(chǎn)者真正受益不多，反而出現(xiàn)大的稅收漏洞，應考慮從制度上解決這一問題，取消農(nóng)產(chǎn)品收購發(fā)票抵扣稅款，一律使用普通發(fā)票作為收購免稅農(nóng)產(chǎn)品扣稅憑證。

　　當前，農(nóng)產(chǎn)品收購發(fā)票開具存在“三亂”。農(nóng)產(chǎn)品收購發(fā)票的開具最明顯的特征是“三自模式”：自己開具、自己付款、自行計算申報抵扣。這“三自”特點直接導致收購發(fā)票管理“三亂”現(xiàn)象的產(chǎn)生。

　　一是農(nóng)產(chǎn)品開具對象之“亂”。按規(guī)定只有從農(nóng)業(yè)生產(chǎn)者個人購買的自產(chǎn)農(nóng)產(chǎn)品，才允許開具收購發(fā)票。隨著市抄濟的發(fā)展，農(nóng)村商販和農(nóng)業(yè)經(jīng)紀人的大量涌現(xiàn)，造成涉農(nóng)加工企業(yè)難以辨別所購貨物是否為農(nóng)業(yè)生產(chǎn)者自產(chǎn)。

　　二是農(nóng)產(chǎn)品價格開具內(nèi)容之“亂”。按規(guī)定收購發(fā)票可以按照收購價格與抵扣率直接計算增值稅抵扣。因此，有的企業(yè)在向小規(guī)模納稅人或個體經(jīng)營者購買農(nóng)產(chǎn)品時，在未取得或有意不取得普通發(fā)票的情況下，也自行填開農(nóng)產(chǎn)品收購發(fā)票入賬，有的還將運費、包裝費等一并列入收購金額開具，從而達到多抵扣稅之目的。

　　三是農(nóng)產(chǎn)品收購企業(yè)稅款征繳之“亂”。按規(guī)定收購發(fā)票每筆收購業(yè)務必須逐筆及時開具。有的企業(yè)將農(nóng)產(chǎn)品收購發(fā)票當作調整各期稅額的“蓄水池”，以便調節(jié)各期應納稅額。

　　國際上對農(nóng)業(yè)生產(chǎn)增值稅政策主要有兩種處理方法：一是將農(nóng)業(yè)生產(chǎn)者與其他納稅人同等對待，納入統(tǒng)一的征稅抵扣機制，憑票扣稅、依率計征;二是對自產(chǎn)農(nóng)產(chǎn)品實行免稅或零稅率，下一環(huán)節(jié)購進免稅農(nóng)產(chǎn)品也存在允許抵扣和不允許抵扣兩種辦法。我國目前還處于傳統(tǒng)農(nóng)業(yè)向現(xiàn)代農(nóng)業(yè)的轉型期，一方面，以家庭為單位的生產(chǎn)組織形式尚不具備將農(nóng)業(yè)生產(chǎn)者納入增值稅征扣稅機制的條件;另一方面，處于起步階段的農(nóng)產(chǎn)品加工流通行業(yè)無法承受不抵扣進項稅款所產(chǎn)生的成本壓力。但從上述問題看，應從制度和管理層面破解這一難題，完善農(nóng)產(chǎn)品收購發(fā)票增值稅管理。

　　完善農(nóng)產(chǎn)品增值稅稅收政策

　　建議統(tǒng)一農(nóng)產(chǎn)品進、銷項計算依據(jù)，堵塞稅收漏洞。改變現(xiàn)行的對農(nóng)產(chǎn)品進項稅額以農(nóng)產(chǎn)品收購發(fā)票注明的“買價”計提進項規(guī)定。以農(nóng)產(chǎn)品收購發(fā)票或取得的普通發(fā)票的票面價款為含稅價款，在計算進項稅額時，先換算為不含稅價款，再按13%的扣除率計算進項抵扣稅款，從稅制上解決因進、銷項計稅依據(jù)、計算口徑不同而造成多抵少征、進大于銷，從而解決農(nóng)產(chǎn)品收購加工企業(yè)長期零稅負申報或低稅負申報，使增值稅抵扣政策更為合理。

　　建議調整抵扣方法，改“購進扣稅法”為“實耗扣稅法”。 我國現(xiàn)行的增值稅制度實行的是“購進扣稅法”。多年的稅收征管實踐一再證明，這種計稅辦法對自開自抵進項稅額的農(nóng)產(chǎn)品收購加工企業(yè)而言，稅務機關確實沒有更好的辦法解決稅款流失的問題。基于此，可考慮用“實耗扣稅法”來解決這個問題。

　　建議統(tǒng)一農(nóng)產(chǎn)品及深加工產(chǎn)品稅率。對以農(nóng)產(chǎn)品為主要原料的生產(chǎn)企業(yè)，國家統(tǒng)一核定，適當降低稅率，以保護以農(nóng)產(chǎn)品為原料企業(yè)的正常利潤。國家出臺農(nóng)產(chǎn)品增值稅優(yōu)惠政策的初衷是促進農(nóng)業(yè)的發(fā)展，農(nóng)產(chǎn)品產(chǎn)業(yè)的發(fā)展需要各個環(huán)節(jié)的緊密配合，而不僅僅是農(nóng)產(chǎn)品的某個階段。但是，按照《財政部、國家稅務總局關于印發(fā)〈農(nóng)產(chǎn)品征稅范圍注釋〉的通知》(財稅〔1995〕52號)文件中的農(nóng)產(chǎn)品范圍分別確定初級農(nóng)產(chǎn)品稅率為13%，對以農(nóng)產(chǎn)品為原料生產(chǎn)的工業(yè)品則需按17%稅率征稅，這不僅與稅法的公平原則相背離，更不利于農(nóng)產(chǎn)品深加工行業(yè)的發(fā)展，最終會影響農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)的發(fā)展。可以考慮將初級農(nóng)產(chǎn)品及深加工農(nóng)產(chǎn)品增值稅稅率統(tǒng)一為13%，以體現(xiàn)增值稅稅收中性的本質，最大限度體現(xiàn)稅法公平和落實優(yōu)惠政策，支持農(nóng)業(yè)生產(chǎn)的發(fā)展，提高我國農(nóng)產(chǎn)品精深加工行業(yè)的競爭力。

　　改進農(nóng)產(chǎn)品增值稅管理

　　通過第三方支付農(nóng)產(chǎn)品收購貨款。因“以票控稅”在農(nóng)產(chǎn)品收購發(fā)票增值稅管理上存在漏洞，是否考慮“以資金控稅”來加強管理，即要求農(nóng)產(chǎn)品收購企業(yè)在銀行、農(nóng)村信用社等設立專戶，由第三方支付農(nóng)產(chǎn)品收購貨款。隨著金融分支機構在廣大農(nóng)村地區(qū)的普及，以及互聯(lián)網(wǎng)金融的發(fā)展，農(nóng)產(chǎn)品收購交易的第三方支付成為可能。

　　運用信息技術，加大納稅評估力度。加大對農(nóng)產(chǎn)品抵扣企業(yè)納稅評估力度，著重對農(nóng)產(chǎn)品收購業(yè)務的票、款、是否一致，對象是否合法、資金流轉是否正常、收購數(shù)量與企業(yè)的生產(chǎn)能力是否匹配，賬面庫存與實物庫存是否一致等方面進行重點評估。

　　從增值稅原理分析，應取消農(nóng)產(chǎn)品收購發(fā)票

　　從增值稅設計原理分析，上一環(huán)節(jié)征了稅下一環(huán)節(jié)方可憑購貨發(fā)票進行稅款抵扣。理論上講，農(nóng)產(chǎn)品免稅，就不應該允許稅款抵扣。國家出于保護農(nóng)業(yè)生產(chǎn)者的利益，出臺憑收購發(fā)票抵扣的政策，實際上農(nóng)業(yè)生產(chǎn)者真正受益不多，反而出現(xiàn)大的稅收漏洞，應考慮從制度上解決這一問題，取消農(nóng)產(chǎn)品收購發(fā)票抵扣稅款，一律使用普通發(fā)票作為收購免稅農(nóng)產(chǎn)品扣稅憑證。這樣，一般納稅人在購進農(nóng)產(chǎn)品時，自然要向出售者索取普通發(fā)票用于抵扣，從而促使中間商到稅務機關辦理稅務登記領取普通發(fā)票，有效地防止稅收流失。對少數(shù)農(nóng)業(yè)生產(chǎn)者偶爾出售免稅農(nóng)產(chǎn)品給一般納稅人的，可攜帶戶籍證明等到國稅機關免費代開普通發(fā)票。可以說，稅務機關代開的普通發(fā)票和中間商開具的普通發(fā)票比一般納稅人自己開具的收購發(fā)票要真實可靠得多。